马克思主义学院成立于2017年5月，源于1979年学校成立的马列主义教研室，其前身为2011年学校建立的思想政治理论课教学科研部，是直属学校领导的教学科研二级机构。负责思想政治理论课教学、科研、社会服务和有关管理工作；负责马克思主义理论学科建设、人才培养和教学科研队伍建设等工作。学院内设哲学教研室、习近平新时代中国特色社会主义思想教研室、马克思主义中国化教研室、历史教研室、思想道德与法治教研室、形势与政策教研室、心理健康教育教研室7个教学机构；学院办公室、教学与科研管理办公室、学生工作办公室3个行政管理机构；学科与研究生教育办公室、思政课实践教学培训指导中心2个教辅机构。

学院师资力量较为雄厚，具有高级职称的教师50余人，其中教授20余人。队伍中有全国五一劳动奖章获得者、享受国务院政府津贴、全国思想政治工作创新奖特等奖获得者、全国模范教师、全国优秀教师、全国高校优秀思想政治理论课教师、全国高校思政课教学展示活动特等奖获得者等10余人次；有市级及以上骨干教师、学科专家等24人次。近五年获得国家级荣誉6人次，市级荣誉3人次，重庆市委组织部、宣传部、人社局、总工会、教委等荣誉16人次。

学院2006年获批马克思主义中国化和思想政治教育2个二级学科硕士点，2011年被国务院学位办增列为马克思主义理论一级学科硕士学位授权单位，2019年获评为重庆市重点马克思主义学院。马克思主义理论学科2011年成为重庆市立项建设重点学科，2016年成为“十三五”重庆市重点学科，2021年成为“十四五”重庆市重点学科。2023年学院“交通文化研究中心”获批“重庆市人文社会科学重点研究基地”，获批成立“重庆市思想政治理论课教师研修基地暨创新发展中心”。

学院现有国家级一流本科课程2门：《中国近现代史纲要》《形势与政策》；省部级一流本科课程5门：《马克思主义基本原理》《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》《思想政治理论课综合实践》《感悟“两路”精神，传承红色基因》《大学生心理健康教育》。